伯豪生物官網(wǎng) m.wokopo.com.cn 新消息 單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序技術服務來了

伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序（single-nucleus RNA sequencing，snRNA-seq）是從組織抽提細胞核，然后在單個細胞核水平上對轉(zhuǎn)錄組進行高通量測序分析的一項新技術，通過檢測單個細胞核的基因表達狀態(tài)，進而揭示細胞間的異質(zhì)性。

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

冷凍樣本和難消化樣本的解決方案

1、適用于凍存組織樣品；克服新鮮樣品時效性限制；

2、適用于難以制備單細胞懸液的組織樣品；

3、減少解離偏差，能更好地保留細胞類型多樣性；

4、不需要酶促消化，真實反映細胞的組分。

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

1、高質(zhì)量抽核：抽核經(jīng)驗豐富，針對不同組織優(yōu)化了解決方案；

2、標準化內(nèi)控：豐富的實操經(jīng)驗構建了標準化的內(nèi)控體系；

3、流程化分析：完善的分析流程，準確快速解析單細胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)；

4、專業(yè)的團隊：專業(yè)的技術團隊具有多年項目方案設計、實驗操作、售后分析等經(jīng)驗；

5、全流程服務：提供組織抽核、單細胞核捕獲、反轉(zhuǎn)錄、建庫測序及數(shù)據(jù)分析的全套服務。

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

1、組織用量：黃豆粒大小 1 塊；

2、樣本處理：組織液氮速凍，-80℃保存；

3、質(zhì)量要求：組織 RNA 無降解，RIN≥7；

4、運輸方式：干冰運輸。

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

冷凍樣本；FFPE 樣本； 通過消化難拿到高質(zhì)量的單細胞懸液的組織類型。

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

小鼠肝臟單細胞核

人松果體單細胞核

小鼠大腦皮層單細胞核

小鼠心臟組織細胞核 RNA 質(zhì)檢（RIN=8.9）

PCR 驗證組織與細胞核、組織與消化細胞的差別（0 為相同）

結(jié)論：

小鼠大腦皮層，相比于消化細胞，細胞核的表達情況更接近于原始組織樣本。

伯豪生物提供：單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

【單細胞轉(zhuǎn)錄組測序】VS【單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序】結(jié)果對比

1、隨著測序深度的不斷增加，單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序（snRNA-seq）和單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-seq）得到的基因數(shù)相近。

Single-cell DropSeq scDropSeq

2、單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序在細胞分群上與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序沒有區(qū)別

單細胞核數(shù)據(jù)分群結(jié)果 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分群結(jié)果

3、單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序可有效挖掘稀有細胞類型

單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序可以減少組織消化引起的偏差

4、單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果中發(fā)現(xiàn)較少壓力相關基因的表達

[1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita,?et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.

[2]?Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.

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