近年來(lái)，在腫瘤早篩和發(fā)育生物學(xué)研究領(lǐng)域，科學(xué)工作者對(duì)于 DNA 甲基化研究的關(guān)注度持續(xù)高漲。目前 DNA 甲基化的研究，大多數(shù)情況下依然是借助于亞硫酸氫鹽修飾，而該過(guò)程會(huì)引起 DNA 的大量損失。所以需要對(duì)該過(guò)程加以優(yōu)化以滿足 DNA 甲基化超微量研究的需求。伯豪生物通過(guò)大量的實(shí)驗(yàn)測(cè)試，優(yōu)化了該過(guò)程， 現(xiàn)在已經(jīng)具備為客戶提供單細(xì)胞甲基化研究服務(wù)的能力。 結(jié)合單細(xì)胞的 RNA 測(cè)序（Smart-seq），可以從多個(gè)維度深入了解生物體發(fā)育和分化過(guò)程中基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)變化。

DNA 起始量要求低：超微量檢測(cè)，僅需個(gè)位數(shù)的細(xì)胞量；

生信分析：獲取信息量大、可精細(xì)化分析；

數(shù)據(jù)質(zhì)量：mapping ratio，冗余度等接近正常 WGBS 數(shù)據(jù)。

物種：人，大小鼠，其他物種需評(píng)估；

類(lèi)型：細(xì)胞系、原代細(xì)胞、新鮮組織、凍存細(xì)胞；

數(shù)據(jù)量：PE 150bp, 15G；

保存運(yùn)輸：?jiǎn)渭?xì)胞樣本 0.2ml 低吸附管收集，液氮保存，干冰寄送（或聯(lián)系當(dāng)?shù)劁N(xiāo)售寄送保護(hù)液）。

腫瘤異質(zhì)性：揭示癌細(xì)胞的甲基化圖譜；

細(xì)胞分化：繪制細(xì)胞分化調(diào)控表觀圖譜；

免疫微環(huán)境：免疫細(xì)胞激化、分化等過(guò)程的表觀調(diào)控機(jī)制；

神經(jīng)科學(xué)：神經(jīng)細(xì)胞亞型分類(lèi)、探究神經(jīng)相關(guān)疾病的分子機(jī)制。

▲所有基因不同功能區(qū)域的甲基化程度走勢(shì)分析

▲DNA 甲基化與 mRNA 表達(dá)的聯(lián)合分析

▲圈圖展示差異甲基化位點(diǎn)在不同染色體上的分布

題目：人原始生殖細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和 DNA 甲基化譜

發(fā)表雜志：Cell

影響因子：31.398

發(fā)表單位：北京大學(xué)第三醫(yī)院

文章摘要：生殖細(xì)胞對(duì)于將遺傳信息從一代傳遞到下一代以及維持物種的延續(xù)至關(guān)重要。在這里，作者在單細(xì)胞和單堿基分辨率下分析了人類(lèi)原始生殖細(xì)胞（PGCs）從遷移階段到性腺階段的轉(zhuǎn)錄組。人 PGC 顯示獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄模式，涉及多能性基因和種系特異性基因的同時(shí)表達(dá)，其中一部分顯示發(fā)育階段特異性特征。此外，還同時(shí)分析了人類(lèi) PGCs 的 DNA 甲基化組，并發(fā)現(xiàn)其基因組的整體去甲基化。妊娠后大約 10 至 11 周，PGC 幾乎沒(méi)有任何 DNA 甲基化發(fā)生，男性和女性 PGC 中平均甲基化水平僅分別為 7.8% 和 6.0%。該工作為破譯生殖系復(fù)雜的表觀遺傳重編程奠定了基礎(chǔ)，旨在揭示受精卵母細(xì)胞的全能性。

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▲人類(lèi) PGCs 顯示出整體的低甲基化模式

▲PGC 的甲基化程度有明顯的降低，同時(shí) gene body 區(qū)的甲基化程度會(huì)輕微高于兩側(cè)的基因區(qū)間。

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▲不同功能區(qū)域在不同時(shí)期的甲基化程度變化很大

Guo F, Yan L, Guo H, et al. The transcriptome and DNA methylome landscapes of human primordial germ cells[J]. Cell, 2015, 161(6): 1437-1452.

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