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SureSelectXT 甲基化靶向序列捕獲平臺(tái)（Methyl-Seq) 是安捷倫公司推出的甲基化發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)。該平臺(tái)為甲基化基因組區(qū)域研究提供了具有單堿基分辨率的高度可靠的方法。現(xiàn)有目錄化產(chǎn)品包括人、小鼠和大鼠甲基化測(cè)序設(shè)計(jì)。該產(chǎn)品相比常見(jiàn)的甲基化檢測(cè)平臺(tái)具有獨(dú)到的優(yōu)勢(shì)。
通過(guò)檢測(cè)單獨(dú)的 CpG 可獨(dú)具特色地提供比甲基化芯片更多的信息，相比全基因組重亞硫酸鹽測(cè)序，可提高通量并降低成本。可發(fā)現(xiàn)限制性?xún)?nèi)切酶及免疫沉淀所不能檢測(cè)的甲基化區(qū)域。
廣泛應(yīng)用于大小鼠的藥物模型，干細(xì)胞研究、腫瘤和其他復(fù)雜疾病研究，特別適用于大小鼠物種的全表觀基因組的標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)和機(jī)制探尋。
作為 Agilent 公司的認(rèn)證服務(wù)商，伯豪采用穩(wěn)定的 SureSelect 捕獲系統(tǒng)進(jìn)行甲基化捕獲；
具有豐富的表觀功能機(jī)制和生物標(biāo)志物篩選研究經(jīng)驗(yàn)，幫助客戶(hù)發(fā)表多篇高分文章；
專(zhuān)業(yè)報(bào)告解讀系統(tǒng)，對(duì)科研應(yīng)用支持良好。
樣品類(lèi)型：人、小鼠和大鼠；
樣品純度：OD 260/280 值應(yīng)在 1.8～2.0 之間；RNA 應(yīng)去除干凈；
樣品濃度：使用 Qubit 準(zhǔn)確定量 DNA 濃度；
樣品總量：每個(gè)樣品 DNA 起始總量不少于 1ug。
案例：《Nature》主刊報(bào)道胚胎模型的甲基化研究
2i 是 Mek1/2 和 Gsk3β 的抑制劑，L 是白血病抑制因子，S/L 是血清和白血病抑制因子，2i/L 的短期處理可以將小鼠胚胎干細(xì)胞（ES）誘導(dǎo)為與著床前胚胎內(nèi)細(xì)胞團(tuán)（ICM）相似的狀態(tài)。同時(shí)延長(zhǎng) 2i/L 處理時(shí)間，可導(dǎo)致小鼠 ES 細(xì)胞中一系列不可逆的表觀遺傳和基因組變化，并損害其發(fā)育潛力，而這一影響是由長(zhǎng)時(shí)間抑制 Mek1/2 引發(fā)的。
結(jié)果表明，2i/L ES 細(xì)胞的衍生可導(dǎo)致 DNA 甲基化的廣泛降低，包括配子來(lái)源的甲基化。這些胚胎干細(xì)胞在胚胎和胎盤(pán)發(fā)育過(guò)程中表現(xiàn)出損傷，說(shuō)明了 2i/ L 建立的胚胎干細(xì)胞在多能干細(xì)胞質(zhì)量方面的局限性。作者的發(fā)現(xiàn)對(duì)于理解人類(lèi)幼稚型多能干細(xì)胞在治療應(yīng)用和疾病建模方面的具有重要意義，因?yàn)樵谶@些細(xì)胞中往往丟失印記和卵母細(xì)胞來(lái)源的甲基化記憶。作者還發(fā)現(xiàn)，早期傳代的雌性 a2i/L ES 細(xì)胞和 t2i/L ES 細(xì)胞保留了配子來(lái)源的 DNA 甲基化和自主發(fā)育潛能。作者認(rèn)為這些胚胎干細(xì)胞可以作為另一種細(xì)胞培養(yǎng)平臺(tái)，用于早期胚胎發(fā)生的生物學(xué)研究。
Yagi M, Kishigami S, Tanaka A, et al. Derivation of ground-state female ES cells maintaining gamete-derived DNA methylation[J].Nature, 2017, 548(7666): 224.
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